2026-10-14 https://api.researchdata.se/oai-pmh

oai:researchdata.se:2023-258/1 2024-02-09 subject:ssif:10401 subject:ssif:10405 subject:ssif:104 subject:ssif:1 principal:slug:swedish-university-of-agricultural-sciences

info:eu-repo/semantics/other http://purl.org/dc/dcmitype/Dataset https://doi.org/10.5878/8t82-d090 NMR spectra of oilseed rape (Brassica napus) root exudates NMR-spektra av rotexudat från raps (Brassica napus) https://orcid.org/0000-0002-9375-8894 https://orcid.org/0000-0003-0342-9702 Anders Broberg Gustav Nestor Johan Meijer Corine Sandström Analytical Chemistry Analytisk kemi Organic Chemistry Organisk kemi The dataset contains 1D and 2D NMR spectra of root exudates from various varieties of oilseed rape (Brassica napus). A Bruker Avance III 600 MHz spectrometer connected to Topspin version 3.5 was used to record the spectra. Included are 1D-1H-NOESY, (1H,1H)-TOCSY, (1H,13C)-HSQC, CPMG, and 1D-diffusion spectra of intact root exudates as well as 1D-1H spectra of a sample treated with ultrafiltration and solid phase extraction (SPE), respectively. The dataset further includes spectra from a spike-in experiment where different concentrations of five metabolites were added to a pooled root exudate sample as well as a blank sample. All samples have been freeze-dried and dissolved in D2O. The data was used to develop an automated targeted metabolomics workflow called extended AQuA. Datasetet innehåller 1D- och 2D-NMR-spektra av rotexudat från olika sorters raps (Brassica napus). Spektrumen erhölls med en Bruker Avance III 600 MHz NMR-spektrometer via Topspin version 3.5. För intakta rotexudat finns 1D-1H-NOESY, (1H,1H)-TOCSY, (1H,13C)-HSQC, CPMG- och 1D-diffusionsspektra. I datasetet ingår även 1D-1H-spektra av ett prov som har ultrafiltrerats respektive passerat en SPE-kolonn (fastfasextraktion), samt spektra från ett spikningsexperiment där olika koncentrationer av fem metaboliter satts till både ett poolat rotexudatprov och ett blankprov. Alla prover har frystorkats och sedan lösts upp i D2O. Datan användes för att utveckla "extended AQuA", ett automatiserat arbetsflöde för kvantitativ metabolomik. info:eu-repo/semantics/openAccess https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Swedish University of Agricultural Sciences Sveriges lantbruksuniversitet 2024-02-09T15:35:08.33795Z eng