2026-10-12 https://api.researchdata.se/oai-pmh

oai:researchdata.se:2024-497/1 2026-03-05 subject:ssif:30107 subject:ssif:30110 subject:ssif:30202 subject:ssif:30203 subject:ssif:301 subject:ssif:302 subject:ssif:3 principal:slug:karolinska-institutet

info:eu-repo/semantics/other http://purl.org/dc/dcmitype/Dataset https://doi.org/10.48723/kfy8-5r05 Data for: Tumor evolution and immune microenvironment dynamics in primary and relapsed mantle cell lymphoma Data för: Tumörevolution och dynamik i den immuna mikromiljön vid primär och recidiverad mantelcelllymfon (MCL) https://orcid.org/0000-0002-4368-8672 https://orcid.org/0000-0003-1990-8804 0009-0003-2408-9732 0000-0002-1214-1340 Medical Genetics and Genomics Medicinsk genetik och genomik Immunology in the Medical Area Immunologi inom det medicinska området Hematology Hematologi Cancer and Oncology Cancer och onkologi Data availability This dataset can only be shared within Sweden due to legal restrictions. Abstract: Mantle cell lymphoma (MCL) is a rare but often aggressive type of B-cell lymphoma with a high risk of relapse. To understand the mechanisms driving disease relapse, we employed single-cell RNA sequencing (scRNAseq) in 20 samples from diagnosed/untreated (primary, n = 11) and/or relapsed tumors (n = 9) from 11 MCL patients. Whole-genome sequencing was also performed on the available samples. The total size of the deposited data is approximately 1.3 TB. It contains 70 GNU zipped fastq files with raw data and one documentation file in xlsx format. All fastq file names are included in the documentation file metadata.xlsx. Tillgänglighet för data Datasetet kan endast delas inom Sverige på grund av juridiska restriktioner. Sammanfattning: Mantelcelllymfom (MCL) är en ovanlig men ofta aggressiv typ av B-cellslymfom med hög risk för återfall. För att förstå mekanismerna bakom sjukdomsrelaps använde vi single-cell RNA-sekvensering (scRNAseq) på 20 prover från diagnostiserade/obehandlade (primära, n = 11) och/eller återfallna tumörer (n = 9) från 11 MCL-patienter. Helt genomsekvensering (WGS) utfördes också på tillgängliga prover. Den totala storleken på den inlagda datan är cirka 1,3 TB. Den innehåller 70 GNU-zippade fastq-filer med rådata och en dokumentationsfil i xlsx-format. Alla fastq-filnamn finns inkluderade i metadatafilen documentation file metadata.xlsx. info:eu-repo/semantics/restrictedAccess SE Karolinska Institutet Karolinska Institutet 2025-07-15T11:49:54.364076Z eng