2026-10-11 https://api.researchdata.se/oai-pmh

oai:researchdata.se:2025-160/1 2025-10-29 subject:ssif:10611 subject:ssif:40104 subject:ssif:106 subject:ssif:401 subject:ssif:1 subject:ssif:4 principal:slug:swedish-university-of-agricultural-sciences

info:eu-repo/semantics/other http://purl.org/dc/dcmitype/Dataset https://doi.org/10.5878/vf2y-k398 Analysis of Ectomycorrhizal Fungal Diversity, Relative Abundance, and Community Data in Effaråsen Scots Pine Forests: Effects of Tree Retention Level, Tree Distance, and Size. Analys av diversitet, relativ abundans och artsammansättning av ektomykorrhizal svamp i tallskogarna vid Effaråsen: Effekter av hänsynsnivå, trädavstånd och kronstorlek. https://orcid.org/0000-0002-1415-3476 https://orcid.org/0000-0003-4536-7765 https://orcid.org/0000-0002-3384-4547 https://orcid.org/0000-0002-3669-6797 Ecology Ekologi Forest Science Skogsvetenskap Environment Miljö This dataset comprises ecological and taxonomic data collected in 2017 from Scots pine forest stands in Effaråsen, Sweden, focusing on ectomycorrhizal (ECM) fungi diversity and SCATA counts. It includes three data files: (1) ECM2017.csv, the raw data, containing relative abundance data for ECM fungi across 245 soil samples with associated retention level categories; (2) stand_leveldata.csv, the aggregated data to the stand level, providing ecological data for the 25 forest stands ; and (3) tax_2017.csv, which lists species taxonomy, SCATA groups, genus, and functional group classifications for the species present in the study. The data were processed using SCATA or standardized taxonomic grouping. An accompanying R script (R_code_clean.R) performs data cleaning, diversity estimation using iNEXT, multivariate ordination (NMDS), correlation analyses, and visualization. This script requires specific R packages listed in the R file, and assumes data files are stored in a relative ./data directory. The dataset supports ecological and mycological research by providing detailed community composition and environmental variables relevant to Scots pine forest fungal diversity in northern Sweden. Dessa data består av ekologiska och taxonomiska data insamlade 2017 från tallskogar i Effaråsen, Sverige, med fokus på diversitet i form av SCATA-räkningar för ektomykorrhizasvampar (ECM). Den innehåller tre datafiler: (1) ECM2017.csv, rådata med relativ abundansdata för ECM-svampar från 245 jordprover med tillhörande retentionnivå-kategorier; (2) stand_leveldata.csv, aggregerade data på beståndsnivå som innehåller ekologiska data för 25 skogsbestånd; och (3) tax_2017.csv, som listar artens taxonomi, SCATA-grupper, släkte samt funktionella gruppindelningar för de arter som förekommer i studien. Data har bearbetats med hjälp av SCATA eller standardiserad taxonomisk gruppering för att underlätta statistiska analyser. Ett medföljande R-skript (R_code_clean.R) utför datarengöring, uppskattning av diversitet med iNEXT, multivariat ordination (NMDS), korrelationsanalyser och visualiseringar. Detta skript kräver specifika R-paket som anges i R-filen och förutsätter att datafilerna finns i en relativ mapp ./data. Datasetet stöder ekologisk och mykologisk forskning genom att tillhandahålla detaljerad information om artsammansättning och miljövariabler som är relevanta för ECM-svampars mångfald i tallskogar i norra Sverige. info:eu-repo/semantics/openAccess SE http://sws.geonames.org/2699767 http://sws.geonames.org/2691395 https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/ Swedish University of Agricultural Sciences Sveriges lantbruksuniversitet 2025-10-29T09:37:31.448602Z eng swe